それぞれのOSを、別々のPCで扱っていませんか? 98→vistaの間に、それを搭載しているPCの能力も桁違いに変化しています。 特にグラフィックボードの性能は直接描画に響きます。得意不得意もあるようで、 私のPCでは3Dがスイスイなのに半透明処理が出たとたんハングアップします。 directXが入っていれば、dxdiagなどで情報を得られますので、比較してみるのも面白いかもしれません。